毒品危害防制條例於98年5月20日修正公布之第17條新減刑規定，新法規定：「犯第4條至第8條、第10條或第11條之罪，供出毒品來源，因而查獲其他正犯或共犯者，減輕或免除其刑。犯第4條至第8條之罪於偵查及審判中均自白者，減輕其刑。」依法務部98.6.8法檢字第0980802279號函說明，98.05.20修正公布之第 4、11、11-1、17、20、25條條文自公布後6個月（98年11月20日）施行。
然而，依法院實務見解（臺灣高等法院98年度上重訴字第28號刑事判決），法院認定：毒品危害防制條例98年5月20日修正公布時，因未有施行日期之特別規定，自應由公布日起算至第3日起生效；且綜合適用修正前後之罪刑及相關規定予以比較，修正後第17條新規定顯較修正前規定對被告有利，依現行即修正後刑法第2條第1項前段規定，應整體適用修正後毒品危害防制條例第17條新減刑之規定。
臺灣高等法院98年度上重訴字第28號刑事判決之判決理由摘要如下：
按毒品危害防制條例業已於98年5月20日修正公布，其修正條文之施行日期，同條例第36條固規定：「本條例自公布後6個月施行」，惟按法規之制定與修正，如有特定生效日期之必要，依中央法規標準法第14條或第20條第2項準用第14條之規定，應分別特定其施行日期。法規制定或前次修正基於特殊因素所特定之施行日期，並不適用於日後修正或再次修正之條文，且法律之制定或修正，若未明定施行日期者，中央法規標準法雖未規定應自何時生效，然法律既經制定或修正並經總統公布，自應依一般原則，自公布日起算至第3日起發生效力。
復按92年7月9日 修正公布之毒品危害防制條例第36條之立法理由：「(一)依修正草案第2條第3項規定，法務部需會同衛生署成立審議委員會每3個月定期檢討調整毒品之分級及品項，而本次新增第四級毒品，有需要在新法施行前先經該審議會檢討後再調整公布，爰預留6個月緩衝期，以利處理。(二)依本條例新修正之規定，有必要再訂定相關子法及修正相當法規，以配合本條例之施行，故亦有需要預留適當緩衝期，以利訂頒相關子法及相關法規之配合修正。」故該條規定，顯係因該次修正之需，始預留適當之緩衝期，並非規定嗣後任何修正，均需預留6個月之期間。98年5月20日毒品危害防制條例修正公布時，因未有施行日期之特別規定，自應由公布日起算至第3日起生效。
又毒品危害防制條例修正第4條於98年5月20日以華總一義字第09800125141號公布施行，新法第4條規定：「製造、運輸、販賣第1級毒品者，處死刑或無期徒刑；處無期徒刑者，得併科新臺幣2千萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第2級毒品者，處無期徒刑或7年以上有期徒刑，得併科新臺幣1千萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第3級毒品者，處5年以上有期徒刑，得併科新臺幣7百萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第4級毒品者，處3年以上10年以下有期徒刑，得併科新臺幣3百萬元以下罰金。製造、運輸、販賣專供製造或施用毒品之器具者，處1年以上7年以下有期徒刑，得併科新臺幣1百萬元以下罰金。前5項之未遂犯罰之。」，而舊法第4條規定：「製造、運輸、販賣第1級毒品者，處死刑或無期徒刑；處無期徒刑者，得併科新臺幣1千萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第2級毒品者，處無期徒刑或7年以上有期徒刑，得併科新臺幣7百萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第3級毒品者，處5年以上有期徒刑，得併科新臺幣5百萬元以下罰金。製造、運輸、販賣第4級毒品者，處3年以上10年以下有期徒刑，得併科新臺幣3百萬元以下罰金。製造、運輸、販賣專供製造或施用毒品之器具者，處1年以上7年以下有期徒刑，得併科新臺幣1百萬元以下罰金。前5項之未遂犯罰之。」，經比較修正前後關於罰金刑之規定，固以修正前法律，較有利於行為人，惟按毒品危害防制條例修正第17條亦於98年5月20日以華總一義字第09800125141號公布施行，新法第17條規定：「犯第4條至第8條、第10條或第11條之罪，供出毒品來源，因而查獲其他正犯或共犯者，減輕或免除其刑。犯第4條至第8條之罪於偵查及審判中均自白者，減輕其刑。」，而舊法第17條規定：「犯第4條第1項至第4項、第5條第1項至第4項前段、第6條第1項至第4項、第7條第1項至第4項、第8條第1項至第4項、第10條或第11條第1項、第2項之罪，供出毒品來源，因而破獲者，得減輕其刑。」，經比較新舊法結果，以新法第17條第1項規定，對被告有利，是綜合適用修正前後之罪刑及相關規定予以比較，修正後規定顯較修正前規定對被告有利，依現行即修正後刑法第2條第1項前段規定，應整體適用修正後毒品危害防制條例之規定。
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